CIMEN s’organise suivant 3 axes de recherche qui découlent du cadre défini dans la Stratégie Régionale d’Innovation pour une Spécialisation Intelligente (SRI-SI) :
Microscopies électroniques avancées pour la santé
Microscopies électroniques avancées dans les technologies de production
Microscopies électroniques dans le domaine de l’alimentation
